I ricercatori hanno avuto difficoltà nel dimostrare come la sindrome da fatica cronica sia collegata ai problemi congitivi riscontrate nei pazienti in fase di sperimentazione. Le anomalie riscontrate a livello del sistema nervoso centrale, ed emerse dalla risonanza magnetica, sono minori di quelli emersi in pazienti affetti da sclerosi multipla; in più, non seguono un processo di avanzamento standard. Inoltre gli studiosi non hanno ancora identificato un biomarker unico; uno studio giapponese, però è riuscito a trovare anomalie che potrebbero condurre più facilmente alla conclusione.

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