La selezione è stata fatta da una Commissione multidisciplinare nominata dall'Aifa, che ha operato mediante una serie integrata di indicatori per valutare sia le ricadute in termini di salute e i vantaggi per il Servizio sanitario nazionale, sia i fattori di ordine economico-industriale. Inoltre, per non penalizzare proposte di elevato valore tecnologico provenienti da imprese medio-piccole, tutti i parametri sono stati indicizzati per milione di euro di incentivo richiesto. Gli accordi di programma sono stati istituiti con la legge Finanziaria 2006, art. 1 commi 313-317, per favorire sul territorio nazionale investimenti in produzione, ricerca e sviluppo nel settore farmaceutico, per il triennio 2006-2008, definendo l'ammontare delle risorse disponibili a 100 milioni di euro", ricorda l'Aifa. L'Italia, infatti, pur rappresentando il terzo mercato europeo e il quinto mercato mondiale del farmaco "si trova, come emerge anche dai dati del rapporto European Scoreboard 2007 della Commissione Europea (DG-Research) 1, in posizione marginale rispetto agli altri Paesi del Vecchio continente per quanto riguarda gli investimenti in Ricerca e sviluppo. Scopo degli accordi è anche quello di contribuire al raggiungimento degli obiettivi di Lisbona rispetto ai quali l'Italia ha dei ritardi, in particolare sul raggiungimento del 3% del PIL in investimenti in R&S".