In particolare, ci sono ancora lacune nella conoscenza dei meccanismi molecolari alla base della derivazione delle staminali embrionali dai blastocisti, la regolamentazione dello stato indifferenziato e pluripotente, e il controllo del differenziamento in linee specifiche. Inoltre, non è stato ancora capito il potenziale oncogeno di questo tipo di cellule staminali, limitando il loro utilizzo nella medicina rigenerativa. La via del gene Rb è un segnale chiave che controlla la proliferazione, la sopravvivenza cellulare, la struttura della cromatina e la differenziazione cellulare in cellule di mammifero. I componenti della via Rb sono importanti regolatori della biologia delle staminali embrionali e la manipolazione delle attività di questo percorso potrebbe fornire nuovi mezzi per controllare il destino delle stesse.